制藥企業所要求的凈化車間的目標是確保建立科學、無菌的藥品生產環境、工藝、操作和管理體系，較大限度地消除各種潛在的生物活性、粉塵和熱原污染，生產出高質量的藥品，健康和安全藥物。
凈化車間主要有三大功能：空氣中懸浮的微生物大多附著在粉塵顆粒表面。如果不清除空氣中的微生物，就很難保證藥品的質量。靜脈用藥對生產環境有更高的要求。另外，藥品生產過程中會產生各種粉塵，須清除，防止藥品交叉污染和空氣污染。
隨著人們環保意識的增強和環境質量標準的提高，藥品生產過程中會產生各種粉塵。如果直接排放到大氣中，不僅會污染車間空氣，而且達不到國家環保標準。凈化車間在凈化工程的發展中起著不可或缺的作用。
車間的凈化建設和改造已成為許多醫療衛生企業須重視的工作。隨著科學技術的發展，制造業對空氣潔凈度的要求主要從產品加工精度、產品小型化、產品純度高和產品可靠性四個方面提出。凈化車間技術不僅局限于制藥企業，而且在后續行業中發揮著重要作用。
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